步骤 3:配置 Table Exporter
在项目中找到 Table Exporter 工具,并点击进入配置界面。
Table Exporter 配置
在此界面中,你需要选择要导出的表型数据字段。这些字段通常是与研究目标相关的变量,例如: 年龄、性别、疾病状态、身高、体重等基本信息。Table Exporter 支持将数据导出为不同格式:CSV:适用于大多数数据分析工具(如 Excel、R、Python 等),能够以表格形式查看。TSV:适合更大数据量的处理,且与数据库中的表格数据兼容性更高。SQL:如果你希望导出为 SQL 查询格式,用于后续数据库查询,可以选择此格式。选择适合你需求的导出格式后,点击 Next 进入下一步。在导出时,Table Exporter 还提供了一些额外的输出选项:字段名称(Field Names):你可以选择导出数据时是否包括字段名称作为表头。数据过滤(Data Filtering):根据需要,可以设置过滤条件,仅导出符合条件的数据。
advanced option
配置完成后,点击 Start Export 按钮,DNAnexus 将开始生成导出的数据文件。根据数据量的不同,可能需要一些时间来处理。你可以在 Job History(作业历史)中查看任务进度。
job history